Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms