Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MMP26Q9NRE1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
MMP26Q9NRE1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MMP26Q9NRE1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MMP26Q9NRE1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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