Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMRT3Q9NQL9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms