Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A20Q9NP91 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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