Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM60AQ9NP50 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms