Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD1Q9BXT4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms