Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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C9orf16Q9BUW7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf16Q9BUW7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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