Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms