Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms