Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCCAG3Q96C92 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms