Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGSM1Q2NKQ1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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