Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms