Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms