Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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