Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CKAP5Q14008 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CKAP5Q14008 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CKAP5Q14008 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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