Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms