Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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