Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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