Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
BNIP3Q12983 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms