Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMSP52788 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SMSP52788 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SMSP52788 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SMSP52788 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SMSP52788 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SMSP52788 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMSP52788 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMSP52788 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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