Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms