Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB2P29033 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB2P29033 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB2P29033 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB2P29033 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms