Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMD1P17707 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMD1P17707 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMD1P17707 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMD1P17707 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMD1P17707 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AMD1P17707 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMD1P17707 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMD1P17707 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMD1P17707 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms