Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GATA1P15976 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GATA1P15976 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GATA1P15976 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GATA1P15976 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GATA1P15976 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GATA1P15976 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms