Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SEC24DO94855 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SEC24DO94855 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SEC24DO94855 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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