Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTNSO60931 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTNSO60931 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTNSO60931 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTNSO60931 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTNSO60931 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CTNSO60931 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CTNSO60931 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CTNSO60931 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CTNSO60931 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CTNSO60931 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNSO60931 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CTNSO60931 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNSO60931 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CTNSO60931 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CTNSO60931 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNSO60931 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CTNSO60931 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNSO60931 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNSO60931 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNSO60931 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNSO60931 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNSO60931 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNSO60931 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNSO60931 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNSO60931 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNSO60931 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNSO60931 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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