Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD6O43541 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms