Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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ARL2-SNX15V9GYD0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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ARL2-SNX15V9GYD0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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