Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A2Q9UPR5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms