Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNPO2Q9UMS6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNPO2Q9UMS6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms