Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EBF1Q9UH73 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms