Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms