Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms