Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD11Q9BXL7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms