Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LPIN3Q9BQK8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms