Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SIGMAR1Q99720 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SIGMAR1Q99720 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SIGMAR1Q99720 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SIGMAR1Q99720 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SIGMAR1Q99720 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SIGMAR1Q99720 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SIGMAR1Q99720 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SIGMAR1Q99720 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SIGMAR1Q99720 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SIGMAR1Q99720 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SIGMAR1Q99720 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SIGMAR1Q99720 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SIGMAR1Q99720 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SIGMAR1Q99720 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SIGMAR1Q99720 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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