Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms