Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms