Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms