Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC149Q6ZUS6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms