Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms