Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms