Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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E2F4Q16254 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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E2F4Q16254 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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E2F4Q16254 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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E2F4Q16254 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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