Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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