Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TAF11Q15544 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TAF11Q15544 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TAF11Q15544 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF11Q15544 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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