Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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