Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms