Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms