Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERV3-1Q14264 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERV3-1Q14264 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERV3-1Q14264 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERV3-1Q14264 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERV3-1Q14264 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms