Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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COL4A6Q14031 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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COL4A6Q14031 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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COL4A6Q14031 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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